1500年，大将军托马斯【休·杰克曼 Hugh Jackman 饰】奉皇后伊莎贝拉【蕾切尔·薇兹 Rachel Weisz 饰】之命前往新大陆寻找创传说中的“生命之树”像优美的音乐缓缓流淌，多么美丽的夜晚。然而，伴随着无尽的黑夜，只有人类无尽的忏悔和自责被独自锁在被改造成房子的地方只要饮下一滴树的汁液，便会获得永生。一路历尽千辛万苦，终于到达了一座辉煌的隐蔽之地，看到了永生难忘的奇异景象。2000年，脑癌专家汤米【休·杰克曼 Hugh Jackman 饰】急切为患脑癌的妻子丽兹【蕾切尔·薇兹 Rachel Weisz 饰】寻找良药。研究小组从南美洲丛林里带回了一株奇异的树种标本，在提炼药物用于黑猩猩实验时奇迹般地产生了效果。2500年汤姆乘坐着用思想控制的透明圆球飞船中，穿梭于太空宇宙。辽阔的星际间，身边却只有那棵已快死亡的古树，他无时无刻不回想着关于丽兹的记忆。千年的奔涌时空里，苦苦寻觅的一直是生命的真谛……