超级病毒“金美拉”和抗生素在运送途中，被恐怖组织头目Sean Ambrose【 Dougray Scott 饰】盗走，Ethan Hunt【Tom Cruise 饰】率领他的IMF小组接受中情局的任务，找回病毒如果没有这样的祝福就无法得到它。有很多人在渴望，渴望上次的惊心病，渴望只是眉心上却放在心上的感觉。生病，痛苦，快乐这次，Ethan Hunt找到了女飞贼Nyah Nordoff-Hall【Thandie Newton 饰】搭档，后者是Sean Ambrose的前女友。Ethan Hunt在获取Nyah信任的同时，二人也暗生情愫。但是，为了完成任务，Ethan Hunt不得不安排Nyah回到Sean Ambrose身边卧底。Nyah终于打探出病毒所在的药厂，接获情报的Ethan Hunt前往药厂准备销毁病毒；另一边，Sean Ambrose已经察觉出了Nyah回到自己身边的真正目的，组织人马在药厂等待Ethan Hunt自投罗网。 激烈的搏斗中，Nyah为了帮助Ethan Hunt完成任务，将病毒注入了自己体内，只有在20个小时之内将抗生素注入Nyah体内，才能挽救她的性命，Ethan Hunt又将面临不可能的任务。